V roce 1931 byl ve svém psychiatrickém ústavu zabit doktor Richard Vannacutt i jeho personál, poté co se týraní pacienti, podrobovaní šíleným experimentům, vzbouřili a ústav podpálili. Od té doby se tradovalo, že jejich duše jsou v bývalé nemocnici uvězněné a čekají na vysvobození.
V osudu hlavního hrdiny je zachycen příběh celé jedné sovětské generace: dětství strávené na venkově, opravdové přátelství, zaměstnání v sovětské Kleipedě i vzrušující erotika a osudová láska – vše neuvěřitelně prosté a zároveň bolestně skutečné. Vodní vír je film o muži, jehož život, který poznamenala...