Dvacet let po událostech filmu Matrix Revolutions žije Neo zdánlivě obyčejný život Thomase A. Anderson v San Francisku, kde mu terapeut předepisuje modré kapsle. On ani Trojice se navzájem nepoznávají. Morfeus mu však nabídne červenou kapsli a znovu mu otevře mysl do světa Matrixu.
Hvězda NBA, zkorumpovaný policajt, ženské rapové duo, teenage punkeři, neonacisté a výběrčí dluhů směřují v roce 1987 v Oaklandu v Kalifornii k nevyhnutelnému střetu.
