Shinji se po čtrnácti letech od třetího impaktu dostáva z Unit-01 a zjišťuje, že se změnil nejen svět, ale i lidé, které znal. Jeho nový známý Kawora mu vysvětlí situaci, o které všichni ostatní mlčeli. Když si Shinji uvědomí, že třetí impakt vznikl jeho zásluhou, společně se pokusí vzniklé škody napravit. Ne vždy...
V předcházejících bojích proti nestvůrným Andělům pomocí obřích robotů, zvaných Eva, mladí piloti Shinji a Rei byli nuceni nést osud lidstva na svých ramenech. Nyní, Andělé chystají apokalyptický Třetí dopad, který by vyhladil lidstvo. Navíc Shinji a Rei musí sdílet své osudy s dvěma novými piloty Evy, namyšlenou a...
