Film se odehrává v Chicagu téměř deset let po okupaci mimozemšťany. Captive State zkoumá životy na obou stranách konfliktu. Na straně jedné jsou mimozemšťané společně s kolaborujícími lidmi, na straně druhé jsou lidé, kteří proti okupaci povstanou. Zejména díky vládnímu úředníkovi, jehož úkolem je sjednotit svět...
Malik má šťastné manželství, zdravého syna a v zaměstnání se mu také daří. Vše se začne bortit, když se po divokém večírku probudí v hotelovém pokoji s bývalou láskou, a nic si nepamatuje...